جانباز شیمیایی مصطفی بابایی در سال 1341 در شهرستان قائم شهر در استان مازندران دیده به جهان گشود.
پس از اخذ دیپلم متوسطه در سال 1361، به تحصیل در مرکز تربیت معلم پرداخت و پس از اتمام دوره دو ساله دانشسرا به استخدام رسمی آموزش و پرورش درآمد و به عنوان معلم مشغول به کار شد.
او در طول سالهای جنگ تحمیلی چندین بار در جبهه حضور یافت و در صف مقدم دفاع از انقلاب و کشور اسلامی قرار گرفت.
مصطفی بابایی در سال 1366 همزمان با حضور در جبهه در مقطع کارشناسی رشته «الهیات و معارف اسلامی» پذیرفته شد.
در همان سال در عملیات کربلای 8 از ناحیه سر، کمر و پاها مجروح شد و دچار موج انفجار گردید.
پس از طی دوره درمان و بهبودی نسبی، مجدداً در سال 1367 عازم مناطق عملیاتی شد و در حمله ناجوانمردانه دشمن به همراه عدهای از همسنگران خود دچار مجروحیت شیمیایی گردید.
او پس از پایان جنگ تحصیلات خود ادامه داد و بعد از اخذ مدرک کارشناسی، در مقطع کارشناسی ارشد رشته فقه و مبانی حقوق اسلامی دانشگاه آزاد اسلامی پذیرفته و مشغول به تحصیل گردید.
وی هم اینک در کسوت دبیری در یکی از مراکز آموزشی در شهرستان قائم شهر مشغول به کار می باشد.
موضوع پایان نامه تحصیلی اش عبارت است از: «ترجمه و تحقیق در موضوع ربا از کتاب مختلف الشیعه علامه حلی» به راهنمایی استاد محمد جعفری هرندی که در سال 1379 و در 120 صفحه به نگارش در آوردهاست.