سال 1349 به جرگه فضانوردان پيوست و سال‌ها به عنوان فضانورد ذخيره در طرح سايوز ـ آپولو مشغول به تمرين بود.
او سال 1357 به همراه ماكارف و سوار بر سايوز ـ 27 به ساليوت ـ 6 سفر كرد و يك هفته در فضا اقامت داشت. او دو بار ديگر به فضا سفر كرد تا اين كه سرانجام و در ماموريت سايوز ـ تي12 كه وي فرماندهي آن را نيز به عهده داشت، به همراه استلانا ساويتسكايا راهپيمايي فضايي كرد.
آخرين ماموريت فضايي ژانيبكف فرماندهي سايوز ـ تي13 بود كه طي آن، او و فضانورد همكارش، ساوينيخ توانستند ايستگاه فضايي ساليوت ـ 7 را كه سيستم برق آن از كار افتاده بود، تعمير و دوباره راه‌اندازي كنند.
ولاديمير ژانيبكف چهارم تير ماه 1365 از فضانوردي كناره‌گيري كرد. او فضانوردي هنرمند است و به نقاشي علاقه فراواني دارد. تابلو‌هاي زيباي ژانيبكف درباره فضا و فضانوردي مسحوركننده است.
