آیت الله خامنه ای تحقیق و تألیف را از دوران طلبگی آغاز كرد و تقریرات دروس اساتید خود را نگاشت و قبل از پیروزی انقلاب به ترجمه و تألیف چند اثر نیز همت گماشت.
تألیف ها و پژوهش ها:
۱ـ چهار كتاب اصلی علم رجال
۲ـ طرح كلی اندیشه اسلامی در قرآن
۳ـ پیشوای صادق
۴ـ از ژرفای نماز
۵ـ صبر
۶ـ روح توحید نفی عبودیت غیرخدا
۷ـ گزارشی از سابقه تاریخی و اوضاع كنونی حوزه علمیه قم
ترجمه ها:
۱- آینده در قلمرو اسلام، نوشته سیدقطب
۲- صلح امام حسن: پرشكوه ترین نرمش قهرمانانه تاریخ، نوشته شیخ راضی آل یاسین
۳- تفسیر فی ظلالالقرآن، نوشته سیدقطب
۴- مسلمانان در نهضت آزادی هندوستان، نوشته عبدالمنعم النمر
۵- ادعانامه علیه تمدن غرب (ترجمه و تحقیقات)
علاوه بر آن، بسیاری از آراء و اندیشه های ایشان كه در گفتار و نوشتار ایشان و در قالب پیام، سخنرانی، خطبه، مصاحبه منعكس شده است به صورت كتاب و نرمافزار با عناوین گوناگون و به صورت موضوعی منتشر گردیده و برخی از آنها نیز به زبانهای دیگر ترجمه شده است. همچنین، پایاننامه ها، رساله ها، مقالات و كتاب های گوناگونی ناظر به افكار و اندیشه های ایشان تألیف و تدوین شده است. نیز، بخشی از مجموعه بیانات و مكتوبات ایشان در دوره رهبری با عنوان «حدیث ولایت» منتشر گردیده است.
