ممكن است هنگام نصب ويندوز به مشكل انتخاب بين FAT و FAT32 و NTFS دچار ترديد شده باشيد. براي اينكه بدانيد سيستم عاملي كه استفاده مي كنيد با چه نوع فايلهاي سيستمي قابل راه اندازي است از جدول زير كمك بگيريد.
سيستم عامل              فايلهاي سيستمي كه پشتيباني مي شود
FAT                                                     MS-DOS
FAT                                             Windows 3.1
FAT                                               Windows 95
FAT, FAT32                        Windows 95 OSR2
FAT, FAT32                                  Windows 98
FAT32, NTFS                            Windows 2000
FAT32, NTFS                                Windows XP