سقط جنين به معناي پايان يافتن بارداري در هر‌مرحله‌اي است كه زندگي نوزاد در جريان است. علائم دقيق و قطعي سقط جنين مشخص نيست.

بيشتر سقط‌هايي كه در سه ماهه اول بارداري رخ مي‌دهد، به دليل ناهنجاري‌هاي كروموزومي در جنين است.

زماني كه سلول تخم تشكيل و تقسيم مي‌شود، ممكن است اختلالاتي در تعداد يا در ساختمان كروموزوم به وجود آيد كه در اين صورت حاملگي طبيعي نيست و بهتر اين است كه جنين در چنين وضع سقط شود. كروموزوم به ساختار بسيار ظريف و كوچك داخل سلول اطلاق مي‌شود كه ژن‌هاي زيادي را حمل مي‌كند.

ژن‌ها تعيين‌كننده خصلت فيزيكي افراد نظير جنس، رنگ مو، رنگ چشم و نوع گروه خوني است. بيشتر ناهنجاري‌هاي كروموزومي به طور اتفاقي رخ مي‌دهد و ربطي به سلامت پدر و مادر ندارد.

معمولا 60 درصد سقط‌ها اين علت را دارد و نگراني در مورد تكرار آن بي‌مورد است، ولي درصد كمي از سقط‌ها ممكن است علت زمينه‌اي داشته باشد كه باعث تكرار سقط شده و بايد از لحاظ مشكلات كروموزومي، مشكلات غدد داخلي و ايمونولوژي بررسي شود.

بعد از يك‌بار سقط جنين، نياز است كه تمام عوامل آن بررسي ‌شود و معمولا بعد از يك‌بار سقط، به طور لزوم احتمال تكرار آن وجود ندارد. توصيه مي‌شود بعد از سقط جنين در فاصله سه ماه، براي بارداري اقدام صورت بگيرد.