شهرستان نايين با مساحتي حدود ۱۲۵/۳۵۷۵۳كيلومتر مربع منطقه اي كويري است كه بين ۲۲درجه و ۴۵دقيقه تا ۳۴درجه و ۳۰دقيقه عرض شمالي و ۵۲درجه و ۴۵دقيقه تا ۵۵درجه طول شرقي نصف النهار گرينويچ واقع شده است. اين شهرستان ازشمال به شهرستانهاي سمنان، شاهرود، از استان سمنان و از جنوب به شهرستان اردكان از استان يزد و بخش كوهپايه از استان اصفهان و از غرب به شهرستان اردستان و از شرق به شهرستان طبس از استان يزد محدود مي باشد.

مركز اين شهرستان شهر نايين كه در طول ۵۳درجه و ۴دقيقه و ۱۵ثانيه خاوري و عرض ۳۲درجه و ۵۱دقيقه و ۵ثانيه شمالي نصف النهار مبداً قرار گرفته و ارتفاع متوسط آن نسبت به سطح دريا در حدود ۱۵۴۵متر تقريباً همسطح شهر اصفهان مي باشد و بزرگترين و وسيعترين شهرستان استان از نظر مساحت بشمار ميرود بطوريكه ۳/۱خاك استان اصفهان را در برگرفته است و از نظر تقسيمات كشوري شامل سه بخش (مركزي –انارك وخوروبيابانك ) و شامل چهار شهر (نايين، انارك خوروجندق) مي باشد.

از نظر آب و هوائي جزء اقليم بياباني بشمار مي رود و داراي تابستانهاي گرم و خشك و زمستانهاي سرد و خشك مي باشد.