نینجاها بایستی ۱۸ مهارت مختلف را کسب کنند که در طومارهای «توگاکوره ریو» نخستین مدرسه نینجوتسو فهرست شدهاست؛
-
سئی شین تکی کیویو – SeiShin Teki Kyoyo – فرهنگ یا پالایش روحی – 教養
-
تای جوتسو – Tai Jutsu – مبارزه بدون سلاح - 体術
-
نینجاتو – Ninjato – مبارزه با شمشیر - 忍者剣
-
بوجوتسو - Bo Jutsu – مبارزه با چوب – 棒術
-
شورایکن جوتسو – Shouriken Jutsu – هنر استفاده از ستاره نینجا - 手裏剣
-
سو جوتسو – So Jutsu – مبارزه با نیزه - 槍術
-
ناگی ناتا جوتسو – Nagi Nata Jutsu – مبارزه با تبرزین - 長刀術 یا 薙刀術
-
کوساری کاما جوتسو – KusariGama Jutsu – داس و زنجیر - 鎖鎌
-
کایاکو جوتسو – Kayaku Jutsu – هنر آتش و انفجار - 火薬術
-
هن سو جوتسو – Henso Jutsu – هنر تغییر چهره و جعل هویت - 変装術
-
شینوبی ایری – Shinubi Iri – ورود مخفیانه به اماکن
-
با جوتسو – Ba Jutsu – هنر سوارکاری
-
سوئی رن جوتسو – Sui Ren jutsu – تمرینات در آب - 水練
-
بوری یاکو – Boryaku – تاکتیک و استراتژی - 謀略
-
چوهو – Choho – جاسوسی و کسب اطلاع - 諜報
-
این تون جوتسو – Inton Jutsu – هنر فرار و مخفی شدن -
-
تن من- Ten mon – شناخت وضعیت آب و هوا - 天門
-
چی مون – chi mon – جغرافیا و جهت شناسی - 地門