رجیستری دارای یک ساختار مرتبه ای hirachal می باشد هر چند که ساختمان آن پیچیده به نظر می آید.اما همانند ساختار پوشه های روی دیسک شما می باشد .شکل ظاهری registryedirot مشابه Windows explorerاست و در آن ساختمان رجیستری به صورت یک ساختار درختی نمایش داده می شود.درساختار رجیستری هر شاخه اصلی (که با یک آیکن ویندوز نمایش داده شده است و کلمه اول آن hkey میباشد hive نامیده می شود .Hive ها شامل key ها هستند .
هر key(کلید)خود می تواند شامل زیر کلید های دیگر نیز باشد.کلید ها ممکن است به زیر کلید های دیگر رجوع کنند و یا به مقدار (value) اشاره کنند.مقادیر شامل اطلاعات واقعی ذخیره شده در رجیستری هستند.پنج نوع مقدار اصلی وجود دارد که عبارتند از:
Expandable_string,multi-string,stringbinary,dword