برگزاری نماز عید فطر و نماز عید قربان، از سنت هایی بود که بعد از پیروزی انقلاب اسلامی در کشورمان احیاء شد، امام خمینی به دلیل کهولت و بیماری اقامه نماز نمی کردند، اما با رهبری آیت الله خامنه ای(۱۳۶۸) تمام نمازهای عید فطر به امامت ایشان اقامه شده است.
شاید دانستن این نکته تاریخی جالب باشد که تنها نماز عیدفطری که در سالهای اخیر به اقامت ایشان اقامه نگردید، عید فطر سال ۱۳۷۱(چهارشنبه ۲۸ فروردین) بود که به دلیل کسالت و عمل جراحی کیسه صفرای رهبرمعظم انقلاب توسط اکبر هاشمی رفسنجانی اقامه شد.
هاشمی رفسنجانی در خاطرات سال ۷۱ خود آورده است:
دیشب نزدیک ساعت دوازده شب،یا زنگ دفتر رهبری بیدار شدیم،آقای محمدی گلپایگانی اطلاع داد درد معده آیت الله خامنه ای شدت یافته و دکترها توصیه به عمل جراحی کرده اند ، ولی فعلا با مسکن خوابیده اند و فردا نمی توانند به نماز عید بروند، خواسته اند که من نماز عید فطر را اقامه کنم،توصیه کردم اگر حالشان نامساعد شد مرا خبر کنند.
