آیت الله بروجردی در این زمینه دو وصیت کرده بودند: ۱- آرامگاه ایشان مساوی زمین باشد و آن را بلند نکنند. ۲- اینکه خانه‌ای که آرامگاه ایشان در آن قرار دارد، مسیر حرم باشد. اما آیا به وصیت اول ایشان عمل شده؟
وصیت آیت‌الله بروجردی این بود که آرامگاه ایشان که هم سطح زمین است، در مسیر رفت و آمد زایران حضرت معصومه (سلام الله علیه) قرار گیرد و خاک کفش زایران روی آرامگاه ایشان بریزد.
آیت الله سید محمد جواد علوی بروجردی نوه آیت الله بروجردی(ره) درباره جایگاه و محل آرامگاه پدربزرگ گرامی‌اش و مرجع تقلید وارسته آن زمان و دلیل قرار گرفتن آرامگاه ایشان در مکان خاصی در حرم مطهر حضرت معصومه(سلام الله علیه) می‌گوید: زمانی که آیت‌الله بروجردی قدس سره مرجع تقلید روزگار خویش بود، اطراف حرم مطهر حضرت معصومه (سلام الله علیه) خانه و مغازه و مسافرخانه بود.
ایشان به منظور ساخت مسجد اعظم، این زمینها و خانه‌ها را خریداری کردند تا اینکه حدود چهارده هزار متر زمین فراهم شد و بنای مسجد اعظم را در آنجا برپا کردند که هم اکنون جزو حرم مطهر شده است.
ایشان در ادامه سخنانش توضیح می‌دهد: به یاد دارم که هنوز همه زمین های اطراف حرم تصرف نشده بود که آیت الله بروجردی خانه کوچکی به مساحت ۶۰ متر مربع را که هم اکنون محل آرامگاه ایشان است، از مال شخصی خود خریدند. بعد از مشخص نمودن محل دفن خود، باقی زمینها را وقف مسجد کردند و به همین دلیل، اکنون در اطراف آرامگاه ایشان نمی‌توان کسی را دفن کرد. آیت الله بروجردی در این زمینه دو وصیت کرده بودند:
۱- آرامگاه ایشان مساوی زمین باشد و آن را بلند نکنند.(که البته در عکس مقبره بلند تر است!)
۲- اینکه خانه‌ای که آرامگاه ایشان در آن قرار دارد، مسیر حرم باشد. چنان که تا مدت ها این محل، راهرویی بود که خیابان موزه را به صحن مسجد اعظم متصل می‌کرد. وصیت آیت‌الله بروجردی این بود که آرامگاه ایشان که هم سطح زمین است، در مسیر رفت و آمد زایران حضرت معصومه (سلام الله علیه)قرار گیرد و خاک کفش زایران روی آرامگاه ایشان بریزد و بدین ترتیب، آرامگاه‌شان به خاک قدم زایران آن حضرت متبرک شود .
