اگر علاقه مندان نگهداری آکواریوم سوال می کنند که آیا لازم است که پس از مداوای بیماری،آکواریوم ضد عفونی شود یا خیر،دادن یک جواب کلی عملی نیست.در مورد انگل های خارجی اگر معالجه کاملا انگل ها را از بین برده باشد و یا حتی تعداد آن ها را کاهش داده باشد،ضدعفونی آکواریوم چندان ضروری به نظر نمی رسد.ولی در مورد انگل ها و بیماری های خطرناک داخلی مانند بیماری های حاصله از ایکتیوفونوس و پلیستوفورا به آسانی احتمال دارد که ماهی های سالم نیز آلوده گردند.بنابراین پس از مداوای آن ها لازم است به بهترین وجه ضدعفونی شود.
برای این منظور ابتدا باید آکواریوم کاملا خالی شود.اگر هنگام تخلیه برخی از گیاهان خراب شده و قابل مصرف نبودند،بهتر است آن ها را دور انداخت.در صورت امکان بهتر است سنگ و ماسه ی کف آکواریوم را تعویض نمود.پس از آن باید آکواریوم خالی را پر از آب کرده و داروی ضدعفونی را به آن اضافه نمود.یکی از بهترین دارو هایی که می توان برای ضدعفونی آکواریوم به کار برد،پرمنگنات پتاسیم است .زیرا هم تهیه ی آن آسان و هم قیمت آن کم است.برای این منظور به ازاء هر ۱۰ لیتر آب آکواریوم،باید یک گرم پرمنگنات پتاسیم به کار برد.پس از بهم زدن محلول،بهتر است آکواریوم را ۴ تا ۵ روز به همان حال نگه داشت و هر چند ساعت یک بار آب آن را به هم زد.پس از شسنشو و آماده نمودن آن می توان ماهی ها را به داخل آکواریوم انتقال داد.اگر رسوب قهوه ای رنگی در کف آکواریوم باقی ماند می توان ضمن شستشوی آن، رسوب موجود را با پنبه ی آغشته به محلول رقیق بیسولفات سدیم از بین برد.
یکی از دارو های قوی ضدعفونی آکواریوم،محلول کلر است.از آن جا که کلر شدیدا سمی است،در مصرف آن باید دقت به عمل آید.محلول هیپوکلرور سدیم برای این منظور به کار می رود.قرص کلر آمین که در همه ی داروخانه ها پیدا می شود نیز برای این کار بسیار مناسب و کم خطر است.این قرص را باید به نسبت ۲ درصد برای ضد عفونی آکولریوم به کار برد.
هنگام ضدعفونی آکواریو الزاما باید تور های دستی و هر چیز دیگری را که برای صید ماهی به کار می رود ،ضدعفونی نمود.در غیر این صورت ضدعفونی آکواریوم به تنهایی تاثیری در جلوگیری از بروز بعدی بیماری ها نخواهد داشت.
