آیت‌الله اراکی در پاسخ به پرسشی درباره سطح علمی لیدر فرقه شیرازی‌ها تأکید کرد: واقعا این بنده خدا تحصیلاتی که او را در حد یک مجتهد بتواند معرفی کند، از ایشان سابقه چنین تحصیلاتی نیست، حالا مجتهد اعظم که جای خود دارد؛ کجا درس خوانده است، هر فردی که مجتهد می‌شود به ویژه در این شرایط که اجتهاد امروزی لازم است، یعنی بتواند مسائل امروزی را استنباط کند، وگرنه اجتهاد زمان شیخ طوسی که کارساز نیست، شیخ طوسی با تمام عظمتی که دارد اگر با معلومات زمان خود اکنون باشد، امروز مجتهد به شمار نمی‌آید، چرا که فقاهت امروز و اصول فقه امروزی بسیار پیشرفت کرده است، البته شیخ طوسی اساس کار ما است، بزرگ ما است، ولی خواه و ناخواه علم فقه ما و اصول ما و این علوم دینی که اساس اجتهاد هستند امروز در حدی رشد کرده‌اند که فرد باید در حد اصول و فقه امروزی با تفقه امروزی آشنا شود.
وی گفت: خب حالا فردی درس هیچ یک از اساتید بزرگ و معروف حوزه نرود و یک دفعه بیاید و بگوید من مرجع تقلید و مجتهد هستم، مگر چنین چیزی می‌شود، این کتاب‌های که گاهی به این آقا منتسب است اگر بدهند گروه‌های که رساله‌های سطح چهار را داوری می‌کنند، می‌بینند که کتاب‌های ایشان در سطح رساله سطح چهار قابل ارزیابی نیست، اینها مطالب واقعی است که ما عرض می‌کنیم، این‌که فردی بیاید با ژست، قیافه، تبلیغات، رسانه‌ها و ۱۸ ماهواره بگوید آیت‌الله فلان و تنها مرجع تقلید جهان تشیع، فرد که با این جور حرف ها مرجع تقلید نمی‌شود، از این کلا‌ه‌ها سر ما نخواهد رفت و ما اجازه نمی‌دهیم این راه باز بشود و ساحت قدس مرجعیت این‌گونه لکه دار شود، این را ما اجازه نخواهیم داد.
پرسش دیگر از دبیر کل مجمع جهانی تقریب مذاهب اسلامی درباره رفت و آمد برخی از مراجع و علما با لیدر فرقه شیرازی‌ها و مهر تأیید بودن بر صحت این جریان بود، که وی پاسخ داد: این جریان برای سابق است، هنوز ماهیت این جریان برای بسیاری از دستگاه‌های مرجعیتی ما شناخته شده نبود و با تبلیغاتی که دارند چنین وانمود می‌کردند که گویا اعتبار دارند، اینها ارتباط تشکیلاتی مفصلی دارند، سازمان دهی دارند و سعی داشتند جلب نظر برخی از مراجع را داشته باشند.
وی یادآور شد: اکنون تمام مراجع ما که مقداری با حقیقت این جریان آشنا شده‌اند، وضعیت همانند سابق نیست.
