پاسخ به:بانک مقالات بیماریهای گیاهی
دوشنبه 29 خرداد 1391 10:00 PM
1 : بيماريهاي گياهي 1386; 43(1 (پياپي 169)):1-16. |
جايگاه تاکسونوميکي دو جدايه ايراني ويروس موزائيک نيشکر بر اساس تعيين ترادف نوکلئوتيدي ناحيه '3- ژنوم |
معصومي محمود*,زارع آوا,ايزدپناه كرامت اله |
* مركز تحقيقات كشاورزي و منابع طبيعي فارس، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز |
دو جدايه ايراني ويروس موزائيک نيشکر (Sugarcane mosaic virus, SCMV) به نام هاي KhzL66 و KhzQ86 از مزارع نيشکر شرکت کشت و توسعه نيشکر و صنايع جانبي آن در خوزستان جمع آوري و با استفاده از آغازگرهاي دژنره پوتي ويروس ها يا اختصاصي SCMV، ناحيه '3 ژنوم آنها به روش RT-PCR تکثير و همسانه سازي گرديد. قطعات پس از تعيين ترادف با هم جمع شدند و ترادف قطعه اي به طول 1815 نوکلئوتيد بدست آمد که شامل قسمتي از ژن NIb، کل CP و 3'-UTR بود. ناحيه CP-UTR از اين دو جدايه همراه با ساير جدايه هاي SCMV موجود در GenBank با برنامه هاي (DNASTAR) MegAlign و CLUSTALX آناليز شد. اين جدايه ها با تعدادي از ترادف هاي پوتي ويروس هاي ديگر شامل ويروس موزائيک کوتولگي ذرت (Maize dwarf mosaic virus, MDMV)، ويروس موزائيک سورگوم (Sorghum mosaic virus, SrMV)، ويروس موزائيک قياق (Johnson grass mosaic virus, HGMV)، ويروس موزائيک ايراني قياق (Iranian Johnson grass mosaic virus, IJMV) و ويروس موزائيک زآ (Zea mosaic virus, ZeMV) موجود در GenBank مقايسه و پس از انجام همرديف سازي چندگانه درخت فيلوژنتيکي آنها با روش Neighbor-joinning ترسيم گرديد. در آناليز فيلوژنتيکي 41 ترادف در 5 گروه شامل SrMV, ZeMV, IJMV, JGMV, MDMV و دو زير گروه SCMV (زير گروه I و II) قرار گرفتند. در اين آناليز قرار گرفتن جدايه هاي SCMV از ايران در کنار جدايه هاي مصر و آفريقاي جنوبي در زير گروه I اين احتمال را به وجود مي آورد که استرين هاي ايراني منشا خارجي داشته و با قلمه به کشور وارد شده باشند. |
كليد واژه: ويروس موزائيک نيشکر، نيشکر، ويروس هاي غلات، پوتي ويروس، ايران، خوزستان |
نسخه قابل چاپ |