پاسخ به:بانک مقالات بیماریهای گیاهی
دوشنبه 29 خرداد 1391 9:52 PM
| : بيماريهاي گياهي 1385; 42(2 (پياپي 166)):253-255. |
| آناليز ترادف نوكلئوتيدي ناحيه 3 ژنوم جدايه هاي ويروس موزائيك رگه اي گندم در ايران |
| معصومي محمود,ياسايي سيدمحسن,زارع آوا,افشاري فر عليرضا,ايزدپناه كرامت اله* |
| * بخش گياه پزشكي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز |
|
تعدادي جدايه ويروس موزائيك رگه اي گندم در مناطق مختلف ايران از گندم يا گياهان ديگر جمع آوري و پس از تشخيص سرولوژيكي ويروس، ترادف ناحيه ترجمه نشدني (UTR) در انتهاي 3 ژنوم آن تعيين گرديد. براي اينكار آر. ان. اي. ويروس با mRNA capture kit جذب و cDNA با آغازگر (oligo dT) RCF1 تهيه شد. در واكنش زنجيره اي پليمراز (PCR) با استفاده از جفت آغازگر اختصاصي WSM1/ WSM2 يك قطعه 251 نوكلئوتيدي در ناحيه 3 ژنوم تكثير شد. قطعه تكثير شده در پلاسميد pTZ57R/ T وارد و در باكتري E. coli DH5a همسانه سازي شد. پلاسميد همسانه سازي شده استخراج و ترادف قطعه وارد شده تعيين و با ترادف ساير جدايه هاي WSMV موجود در GenBank مربوط به اروپا، استراليا، آمريكا و تركيه با برنامه CLUSTAL همرديف سازي چند گانه (multiple alignment) شد و درخت فيلوژنتيكي ترسيم گرديد. تشابه نوكلئوتيدي در برنامه MegAlign محاسبه گرديد. براساس رابطه فيلوژنتيكي مشخص شد كه كليه سويه ها و جدايه هاي دنيا در چهار گروه قرار مي گيرند. در اين آناليز جدايه هاي ايران در دو شاخته کاملا مجزا قرار گرفتند. جدايه هاي فلات مرکزي و جنوبي ايران يك گروه كاملا مستقل و جدايي در درخت فيلوژنتيكي تشكيل دادند و جدايه هاي ويروس از شمال غرب كشور همراه با استرين هاي اروپايي در گروه ديگري قرار گرفتند. |
| كليد واژه: گندم، ويروس موزائيك رگه اي گندم، ترادف نوكلئوتيدي، ناحيه ترجمه نشدني، تنوع ژنتيكي |
 |
|
نسخه قابل چاپ |
