پاسخ به:بانک مقالات زیست شناسی
جمعه 5 خرداد 1391 8:47 PM
| 9 : مجله علوم دانشگاه تهران زمستان 1386; 33(4 (بخش زيست شناسي)):27-33. |
| پيشگويي کلاسهاي ساختاري پروتئينها در دو وضعيت با استفاده از مدل ترکيبي عصبي- لوجستيک |
| جهان ديده صمد,عبدالمالكي پرويز*,موحدي محمدمهدي |
| * گروه بيوفيزيک، دانشکده علوم پايه، دانشگاه تربيت مدرس، تهران، ايران |
|
هدف مطالعه پيشنهادي پيشگويي کلاسهاي ساختاري پروتئين ها در دو وضعيت (تمام آلفا و تمام بتا) با استفاده از روش مدل سازي ترکيبي دو مرحله اي با شبکه عصبي مصنوعي (ANN) و مدل لوجستيک رگرسيون (LRM) است. ساختار شبکه و فرايند آموزش طولاني، کاربرد آن را در تمام زمينه ها محدود کرده است. پيشگويي کلاسهاي ساختاري پروتئين ها روي يک سري داده (n=104) از پروتئين هاي غير همولوگ تک دومين کروي اجرا شد. پارامترهاي معنا دار آماري در مدل لوجستيک رگرسيون فراواني تکي اسيد آمينه هاي والين و گليسين همچنين فراواني ترکيبات دوتايي ليزين-پرولين، ايزولوسين-سرين، گلوتامين- سرين و گلوتامين- پرولين بودند. در بين ترکيبات سه تايي نيز تنها فراواني ترکيب آسپاراژين- لوسين- آسپارتيک اسيد معنادار بود. پيشگويي کلاسهاي ساختاري در دو وضعيت (تمام آلفا و تمام بتا) تنها بر اساس هفت شاخص ساختاري معني دار به عنوان متغير هاي ورودي از بين 642 متغير ساختاري 88% کارايي نشان داد. در اين مطالعه، هر دو شاخص وابسته به آستانه و غير وابسته (ROC) براي ارزيابي مدل استفاده شده است. |
| كليد واژه: |
 |
|
نسخه قابل چاپ |
