از دیگر مساجد تاریخی همدان می‌توان به مسجد پیغمبر اشاره کرد؛ جایی که مدفن حضرت حجی (ع) یکی از پیامبران بنی‌اسرائیل است که بر اساس برخی از مستندات تاریخی پس از اسارت به دست بخت‌‌النصر به ایران آمده و در همدان درگذشته است.
هرچند از قدمت و تاریخ ساخت مسجد، اطلاعات دقیقی در دست نیست، اما برخی شواهد از بازسازی آن در دوره قاجار خبر می‌‌دهد. مسجد دارای یک شبستان بوده و سنگ مزار این پیغمبر هم زیر ضریح چوبی مشبک و سبز رنگی قرار دارد که با کاشی‌های فیروزه‌ای رنگ و آبی پوشانده شده است.
