بهينه سازي شرايط PCR جهت نشانگرهاي ملكولي ISSR به منظور انگشت نگاري ژنوم گاو
پنج شنبه 11 آبان 1391 6:01 PM
4 : پژوهشهاي علوم دامي (دانش كشاورزي) 1388; 19(1):31-39. |
بهينه سازي شرايط PCR جهت نشانگرهاي ملكولي ISSR به منظور انگشت نگاري ژنوم گاو |
قاسمي مريم,محمدآبادي محمدرضا*,باقي زاده امين,اسماعيلي زاده كشكوييه علي |
* هسته تحقيقات ژنتيك و حيوانات ترانسژنيك، بخش علوم دامي، دانشگاه شهيد باهنر كرمان |
امروزه نشانگرهاي ملكولي زيادي در دسترس هستند. به دليل سادگي و نياز به مقادير كم DNA، تحقيقات بر مبناي PCR رايج هستند. ISSR، نشانگرهاي چند جايگاهي اختياري ميباشند كه بوسيله PCR با يك پرايمر ميكروساتلايتي تكثير مي شوند. به دليل عدم نياز به اطلاعات قبلي در مورد توالي ژنوم، استفاده از اين نشانگرها فوايد زيادي دارد. بعلاوه، به خاطر عدم نياز به اطلاعات توالي ژنومي كه در دو طرف آنها قرار دارند تجزيه ISSR از نظر تكنيكي ساده تر از بيشتر سيستم هاي نشانگري ديگر است. اين روش نتايجي را فراهم مي كند كه قدرت تكرارپذيري بالايي دارند و چند شكلي بالايي را در بيشتر سيستم ها ايجاد مي كنند. در اين پژوهش، شرايط متفاوت PCR از جمله، غلظت هاي DNA، پرايمر، MgCl2 و dNTP، تعداد چرخه و دماي اتصال مورد آزمون قرار گرفت. بر اساس نتايج حاصل، بهترين شرايط عبارت بودند از: 100 نانوگرم از DNA ژنومي، 2 ميكروليتر پرايمر با غلظت اوليه 10 ميكرومولار، 0.375 ميكروليتر MgCl2 با غلظت اوليه 100 ميلي مولار، 200 ميكرومولار از هر چهار dNTD در 30 چرخه، همچنين تكرارپذيري نشانگرهاي ISSR برآورد شد و مشخص شد كه اين نشانگرها انتخاب بسيار مناسبي جهت انگشت نگاري ژنوم گاو مي باشند. |
كليد واژه: انگشت نگاري ژنوم، فاكتورهاي PCR، نشانگرهاي ISSR |
نسخه قابل چاپ |
أَلْعِلْمُ ثَلاثَةٌ: أَلْفِقْهُ لِلاَْدْیانِ، وَ الطِّبُّ لِلاَْبْدانِ،وَ النَّحْوُ لِلِّسانِ. .